总的来讲，较低的温度对马铃薯贮藏是有利的。马铃薯最适宜的贮藏温度为1--3℃，最高不宜超过5℃；最适宜的空气相对湿度为80--85％。在贮藏初期，低温不仅能延长块茎的休眠期，而且能抑制有害微生物的侵染，减少块茎感病和腐烂。温度降到0℃以下时，块茎即会受冻。即使在O℃的低温条件下贮藏也不适宜，因为块茎中的淀粉和糖在一定条件下会互相转化，在0℃条件下，淀粉水解酶的活动增强，从而促进淀粉的水解，加速淀粉的糖化作用。同时，在0℃的低温条件下，块茎的呼吸作用非常微弱，糖的消耗低于淀粉的糖化作用，则糖相对增多，所以长期在O℃条件下贮藏的块茎，有较甜的味道而失去原来的品味。如果温度升高，则块茎的呼吸作用增强，糖的消耗量也随着增大，同时淀粉酶的活动又恢复和增强，再促进淀粉的合成作用，这使糖的含量大大减少，则丧失甜味。如果贮藏温度不断升降，块茎中的淀粉和糖也反复转化，则淀粉含量会随着贮藏时间的延长而显著下降。因此，贮藏期的窖温既要保持适宜的低温，又要尽可能保持适宜温度的稳定性，防止忽高忽低。此外，贮藏马铃薯还要保持相对湿度的稳定，如果湿度过高，会使块茎腐烂；反之，如果湿度过低，会使块茎中的水分大量蒸发而软缩。马铃薯发芽或经过阳光照射，薯皮变绿处，含有很多茄碱甙，人畜食用会引起中毒。因此，马铃薯贮藏要避免阳光直射。
　　马铃薯块茎具有水分含量高，呼吸作用强，营养物质不稳定等特点，从而形成了对贮藏条件的反应敏感性。一般在适宜的温湿度条件下贮藏，可以安全贮藏6--7个月，甚至更长的时间。安全贮藏必须做到以下几点：
　　第一，根据贮藏期间生理变化和气候变化，应两头防热，中间防寒，控制贮藏窖的温湿度。具体做法是：入窖初期打开窖门和通气孔；当气温降到-5℃左右时关闭窖门，只开通气孔；当气温降到-10℃左右时，应关闭通气孔。气温升高后，不可随便打开窖门和气孔，以防热空气进入，只可短时间通风换气。
　　第二，收获、运输和贮藏过程中，要尽量减少转运次数，避免机械损伤，以减少块茎损耗和腐烂。
　　第三，入窖前要严格挑选薯块，凡是损伤、受冻、虫蛀、感病等薯块不能入窖，以免感染病菌(干腐和湿腐病)和烂薯。入选的薯块应先放在阴凉通风的地方摊晾几天，然后再入窖贮藏。
　　第四，贮藏窖要具备防水、防冻、通风等条件，以利安全贮藏。窖址应选择地势高燥，排水良好，地下水位低，向阳背风的地方建窖。
　　第五，食用薯块，必须在无光条件下贮藏。否则，见光后茄素含量增加，食味变麻，降低食用品质。种用薯块，在散光或无光条件下贮藏均可，不会影响种用价值。